Muziejus įrengtas dviaukštėje zakristijoje-emporoje. Atskiri stendai skirti bažnyčios hierarchams, arkikatedroje tarnavusiems iškiliems dvasininkams bei šiai šventovei ir visai Bažnyčiai Lietuvoje svarbiems istorijos momentams.
Pasak Kauno arkivyskupijos Informacijos tarnybos, muziejaus eksponatai "byloja apie didingą neseniai 600 metų jubiliejų (2013 m.) minėjusios šventovės istoriją nuo pat didžiojo žemaičių ganytojo vyskupo Motiejaus Valančiaus, prievarta carinės valdžios XIX a. pabaigoje perkeltą iš Varnių į Kauną".
Muziejuje pasakojama apie Lietuvos bažnytinės provincijos įsteigimą 1926 m., pal. Jurgio Matulaičio paskutiniųjų gyvenimo metų akimirkas ir atsisveikinimą su juo Kaune 1927-aisiais.
Atskiri stendai skirti kardinolui Vincentui Sladkevičiui, taip pat dabartiniam arkikatedros ganytojui – Kauno arkivyskupui metropolitui Sigitui Tamkevičiui ir nuo jo vardo bei Lietuvos istorijos neatskiriamai "LKB Kronikai", taip pat popiežiui Jonui Pauliui II, kaip piligrimui aplankiusiam arkikatedrą per apaštališkąjį vizitą Lietuvoje 1993 m. rudenį.
Tarp muziejaus eksponatų – fotografijos, įvairūs dokumentai, knygos, medaliai. Čia eksponuojami ir liturginiai drabužiai bei reikmenys, relikvijoriai, kryžiai, paveikslai.
Naujausi komentarai